Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr55Q9CX97 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms