Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Utp23Q9CX11 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Utp23Q9CX11 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Utp23Q9CX11 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Utp23Q9CX11 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Utp23Q9CX11 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Utp23Q9CX11 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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