Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx10Q9CWT3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms