Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms