Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NubplQ9CWD8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms