Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW46

Raver1, Ribonucleoprotein PTB-binding 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver1Q9CW46 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raver1Q9CW46 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms