Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Sycp2Q9CUU3 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms