Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rprd1bQ9CSU0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rprd1bQ9CSU0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rprd1bQ9CSU0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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