Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dis3Q9CSH3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms