Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg12Q9CQY1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms