Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim8Q9CQQ0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms