Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chchd5Q9CQP3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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