Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Nicn1Q9CQM0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Nicn1Q9CQM0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Nicn1Q9CQM0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Nicn1Q9CQM0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Nicn1Q9CQM0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Nicn1Q9CQM0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Nicn1Q9CQM0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nicn1Q9CQM0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
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Nicn1Q9CQM0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
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