Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL4

Mrpl20, 39S ribosomal protein L20, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl20Q9CQL4 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Mrpl20Q9CQL4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Mrpl20Q9CQL4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl20Q9CQL4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl20Q9CQL4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl20Q9CQL4 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl20Q9CQL4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl20Q9CQL4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl20Q9CQL4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl20Q9CQL4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl20Q9CQL4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl20Q9CQL4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl20Q9CQL4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl20Q9CQL4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl20Q9CQL4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl20Q9CQL4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl20Q9CQL4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl20Q9CQL4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl20Q9CQL4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl20Q9CQL4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl20Q9CQL4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl20Q9CQL4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms