Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Atp6v0e1Q9CQD8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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