Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpa3Q9CQ71 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms