Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atg3Q9CPX6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg3Q9CPX6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms