Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms