Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sike1Q9CPR7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms