Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ1

Cox6c, Cytochrome c oxidase subunit 6C, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6cQ9CPQ1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox6cQ9CPQ1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox6cQ9CPQ1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox6cQ9CPQ1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox6cQ9CPQ1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox6cQ9CPQ1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox6cQ9CPQ1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox6cQ9CPQ1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox6cQ9CPQ1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox6cQ9CPQ1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox6cQ9CPQ1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox6cQ9CPQ1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox6cQ9CPQ1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox6cQ9CPQ1 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox6cQ9CPQ1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox6cQ9CPQ1 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox6cQ9CPQ1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox6cQ9CPQ1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox6cQ9CPQ1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox6cQ9CPQ1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox6cQ9CPQ1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox6cQ9CPQ1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox6cQ9CPQ1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox6cQ9CPQ1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox6cQ9CPQ1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms