Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bhlhe41Q99PV5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms