Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rrbp1Q99PL5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms