Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh8Q99NA2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms