Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf17Q99MV7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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