Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnpo2Q99LG2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms