Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms