Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms