Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TriobpQ99KW3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms