Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms