Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp11Q99K46 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms