Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ddb2Q99J79 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms