Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Smim11aQ99J19 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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