Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lmo1Q924W9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms