Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim59Q922Y2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms