Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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Odf3Q920N1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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Odf3Q920N1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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