Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms