Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atpaf2Q91YY4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms