Protein–RNA interactions for Protein: Q91XZ9

Pcdhb20, Protocadherin beta 20, mousemouse

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Length 799 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb20Q91XZ9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdhb20Q91XZ9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdhb20Q91XZ9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdhb20Q91XZ9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdhb20Q91XZ9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdhb20Q91XZ9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdhb20Q91XZ9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdhb20Q91XZ9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdhb20Q91XZ9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pcdhb20Q91XZ9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pcdhb20Q91XZ9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pcdhb20Q91XZ9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pcdhb20Q91XZ9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pcdhb20Q91XZ9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pcdhb20Q91XZ9 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pcdhb20Q91XZ9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Pcdhb20Q91XZ9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Pcdhb20Q91XZ9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcdhb20Q91XZ9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Pcdhb20Q91XZ9 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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