Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Setd3Q91WC0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms