Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx9Q91VH2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms