Protein–RNA interactions for Protein: Q91V51

Ttll1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll1Q91V51 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll1Q91V51 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll1Q91V51 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll1Q91V51 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll1Q91V51 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll1Q91V51 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll1Q91V51 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll1Q91V51 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll1Q91V51 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll1Q91V51 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll1Q91V51 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll1Q91V51 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll1Q91V51 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll1Q91V51 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttll1Q91V51 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms