Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms