Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dkk4Q8VEJ3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms