Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cul7Q8VE73 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms