Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms