Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc58Q8R3Q6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc58Q8R3Q6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccdc58Q8R3Q6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccdc58Q8R3Q6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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