Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PolbQ8K409 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PolbQ8K409 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PolbQ8K409 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PolbQ8K409 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PolbQ8K409 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PolbQ8K409 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PolbQ8K409 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PolbQ8K409 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PolbQ8K409 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PolbQ8K409 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PolbQ8K409 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PolbQ8K409 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PolbQ8K409 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PolbQ8K409 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PolbQ8K409 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PolbQ8K409 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PolbQ8K409 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PolbQ8K409 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PolbQ8K409 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PolbQ8K409 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PolbQ8K409 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PolbQ8K409 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PolbQ8K409 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PolbQ8K409 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PolbQ8K409 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PolbQ8K409 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PolbQ8K409 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PolbQ8K409 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PolbQ8K409 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PolbQ8K409 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PolbQ8K409 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PolbQ8K409 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolbQ8K409 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolbQ8K409 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolbQ8K409 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolbQ8K409 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolbQ8K409 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolbQ8K409 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PolbQ8K409 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolbQ8K409 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PolbQ8K409 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PolbQ8K409 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolbQ8K409 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PolbQ8K409 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolbQ8K409 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolbQ8K409 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PolbQ8K409 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PolbQ8K409 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PolbQ8K409 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PolbQ8K409 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PolbQ8K409 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolbQ8K409 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolbQ8K409 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolbQ8K409 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolbQ8K409 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolbQ8K409 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolbQ8K409 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolbQ8K409 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PolbQ8K409 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolbQ8K409 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolbQ8K409 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PolbQ8K409 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolbQ8K409 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolbQ8K409 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolbQ8K409 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolbQ8K409 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolbQ8K409 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PolbQ8K409 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolbQ8K409 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PolbQ8K409 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolbQ8K409 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PolbQ8K409 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PolbQ8K409 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolbQ8K409 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PolbQ8K409 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolbQ8K409 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolbQ8K409 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PolbQ8K409 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PolbQ8K409 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolbQ8K409 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolbQ8K409 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolbQ8K409 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
PolbQ8K409 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolbQ8K409 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolbQ8K409 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolbQ8K409 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolbQ8K409 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PolbQ8K409 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PolbQ8K409 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PolbQ8K409 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PolbQ8K409 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PolbQ8K409 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PolbQ8K409 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PolbQ8K409 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PolbQ8K409 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PolbQ8K409 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PolbQ8K409 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PolbQ8K409 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PolbQ8K409 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms