Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MyripQ8K3I4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MyripQ8K3I4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms