Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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Lrrtm1Q8K377 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Lrrtm1Q8K377 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Lrrtm1Q8K377 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrrtm1Q8K377 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Lrrtm1Q8K377 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Lrrtm1Q8K377 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Lrrtm1Q8K377 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Lrrtm1Q8K377 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Lrrtm1Q8K377 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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