Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ssh3Q8K330 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ssh3Q8K330 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ssh3Q8K330 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Ssh3Q8K330 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Ssh3Q8K330 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Ssh3Q8K330 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssh3Q8K330 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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